L’équipe de recherche s’intéresse aux mécanismes moléculaires et cellulaires des épilepsies avec malformations corticales causées par des mutations somatiques (PMID: 38710875, PMID: 36635388, PMID: 31444548). Il s’agit d’une équipe multidisciplinaire alliant la bio-informatique, la génétique, et l’établissement de modèles de la maladie in vitro et in vivo.

Objectif principal du projet : Élucider les bases moléculaires et cellulaires des malformations corticales associées à l’épilepsie.

Méthodologie :

• Détection de variants somatiques à partir de données de séquençage du génome (WGS) sur tissus 
• Analyse bioinformatique de données de séquençage d'ARN en cellule unique (scRNA-seq) et de transcriptomique spatiale

• Réaliser le calling des variants somatiques sur des données de génomes en short et long reads
• Analyser la distribution de la fréquence allélique des variants (VAF) et effectuer du lignage cellulaire (lineage tracing) 
• Analyser les données de séquençage d'ARN en cellule unique (scRNA-seq) et de transcriptomique spatiale 
• Intégrer les différents types de données (génomiques et transcriptomiques) 
• Présenter les résultats lors des réunions d'équipe et des congrès scientifiques 
• Participer à la rédaction de rapports scientifiques et de publications

• Master en bioinformatique (avec expérience) ou PhD en bioinformatique/génomique
• Solide expérience en bioinformatique génomique 

Savoir-faire

• Maîtrise des langages de programmation pertinents (ex : Python, R) 
• Expérience dans l’analyse de données de séquençage à haut débit (WGS, RNA-seq) 
• Connaissance des approches d’analyse en cellule unique et de transcriptomique spatiale.
• Maîtrise de l’anglais scientifique (oral et écrit).

Savoir-être

• Capacité à travailler de manière autonome et organisée
• Faire preuve d’une rigueur scientifique
• Aisance relationnelle et à interagir avec les membres de l’équipe
• Curiosité scientifique et capacité d’adaptation à de nouvelles technologies

L’Institut du cerveau s’engage pour lutter contre toute forme de discrimination. Nous garantissons un environnement de travail inclusif et respectueux de toutes les diversités.