L’équipe de recherche s’intéresse aux mécanismes moléculaires et cellulaires des épilepsies avec malformations corticales causées par des mutations somatiques (PMID: 38710875, PMID: 36635388, PMID: 31444548). Il s’agit d’une équipe multidisciplinaire alliant la bio-informatique, la génétique, et l’établissement de modèles de la maladie in vitro et in vivo.

Objectif principal du projet : Élucider les bases moléculaires et cellulaires des malformations corticales associées à l’épilepsie.

Méthodologie :

- Détection de variants somatiques à partir de données de séquençage de l’exome (WES) et du génome (WGS) sur tissus 
- Analyse bioinformatique de données de séquençage d’ARN en cellule unique (scRNA-seq) et de transcriptomique spatiale


MISSIONS PRINCIPALES 

En tant qu’ingénieur(e) de recherche, vous serez chargé(e) de:

- Réaliser le calling des variants somatiques sur des données de génomes en short et long reads
- Analyser la distribution de la fréquence allélique des variants (VAF) et effectuer du lignage cellulaire (lineage tracing) 
- Analyser les données de séquençage d’ARN en cellule unique (scRNA-seq) et de transcriptomique spatiale 
- Intégrer les différents types de données (génomiques et transcriptomiques) 
- Présenter les résultats lors des réunions d’équipe et des congrès scientifiques 
- Participer à la rédaction de rapports scientifiques et de publications

• Master en bioinformatique (avec expérience) ou PhD en bioinformatique/génomique
  - Solide expérience en bioinformatique génomique 
  
  
  Savoir-faire
  
  - Maîtrise des langages de programmation pertinents (ex : Python, R) 
  - Expérience dans l’analyse de données de séquençage à haut débit (WGS, RNA-seq) 
  - Connaissance des approches d’analyse en cellule unique et de transcriptomique spatiale.
  - Maîtrise de l’anglais scientifique (oral et écrit).
  
  
  Savoir-être
  
  - Capacité à travailler de manière autonome et organisée
  - Faire preuve d’une rigueur scientifique
  - Aisance relationnelle et à interagir avec les membres de l’équipe
  - Curiosité scientifique et capacité d’adaptation à de nouvelles technologies
  
  
  L’Institut du cerveau s’engage pour lutter contre toute forme de discrimination. Nous garantissons un environnement de travail inclusif et respectueux de toutes les diversités.