Comme toute Holacracy, Toovalu est structurée en cercles. Un cercle général englobant plusieurs cercles. "Machine à Impact" coordonne l'expérience utilisateur pour favoriser des modèles d'organisation durables. "Écosystème" se subdivise en "Success", expert en transition écoresponsable, et "Sales", engagé dans la promotion de l'économie bas carbone. Le cercle "Humain & Collectif" assure le bien-être et l'alignement des membres avec leurs rôles.
Enfin, le cercle "Vision & Esprit Pionnier" incarne la stratégie et l'innovation de Toovalu, positionnant l'entreprise comme un acteur de référence en matière de climat, RSE et impact. Chaque cercle contribue à la mission globale de Toovalu avec une autonomie renforcée.